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馮平山圖書館藏善本古籍800餘種，包括宋刊本、元刋本、明刋本、明抄本、清刋本、清抄本及稿本、舊抄本、近代抄本等。2003年編制《香港大學馮平山圖書館藏善本書錄》，其後亦增補書目資料，力求充實，以便檢索。本館同時將部份善本古籍數碼化，與各界共享珍貴館藏，讓它們在互聯網這浩瀚天地裏更廣為流傳。本數據庫為數碼化第一階段成果，開放共享善本古籍116種1025冊。

有品格的数字图书馆, 书格, 可下载

為拓展清史研究，本所於民國96年規畫建置清代職官資料庫，105年開放學界使用。

本所於民國八十五年起，建置內閣大庫檔案系統，開發使用者線上瀏覽與檢索等相關功能，旨在提供研究者詳盡且系統化的明清檔案資訊。

漢川草廬是針對二十四史、十三經、資治通鑑等等古籍，進行逐字校對的正體中文網站。